17.9.2014

Вирус Эбола может стать более трансмиссивным
Похороны местного целителя можно считать наиболее вероятным источником распространения в настоящее время вируса Эбола в Сьерра-Леоне — государстве, одном из наиболее серьезно пострадавших от вспышки эпидемии этого вируса, который может затронуть 20 тысяч человек по всей Западной Африке: к такому выводу пришли специалисты Всемирной организации здравоохранения. Отслеживание вируса включает в себя быструю генетическую детективную работу, в результате которой были установлены 395 мутаций, непосредственно связанных с последней вспышкой.
Геном вируса Эбола состоит из РНК, а не из ДНК, и он быстро мутирует. «Каждый случай заражения представляет собой новую возможность для мутации», — отмечает Пардис Сабети (Pardis Sabeti), генетик Broad Institute при Гарвардском университете в Бостоне. Пять известных штаммов вируса Эбола способны заразить человека, а тот, который стал причиной последней вспышки, был ранее идентифицирован как EBOV, а еще его называют «Заирский эболавирус» (Zaire ebolavirus).
С момента своего появления в Гвинее в феврале 2014 года этот штамм вируса Эбола распространился по всей Западной Африке и уже стал причиной гибели тысяч людей. До нынешней вспышки распространение вируса Эбола ограничивалось территорией Центральной Африки, и это — беспрецедентное событие как с точки зрения количества инфицированных, так и с точки зрения географических параметров. Кроме того, этот вирус в ходе своего распространения претерпевает незначительные, но потенциально важные в генетическом отношении мутации.
Лаборатория Сабети работает над методами, позволяющими установить последовательность образцов вируса Эбола, а также вируса Ласса (Lassa), еще одной геморрагической лихорадки. Когда первые признаки потенциальной вспышки вируса Эбола были замечены в Западной Африке, Сабети посадила двух своих сотрудников на самолет и отправила их в Сьерра-Леоне. Она и некоторые ее коллеги по Tulane University работали со специалистами этой страны в Правительственной клинике Kenema и занимались изучением лихорадки Ласса. Эта больница располагала наблюдательной сетью специалистов, которые могли фиксировать случаи заражения вирусом Ласса и Эбола, и с их помощью был установлен первый случай инфицирования вирусом Эбола в Сьерра-Леоне — он был обнаружен у беременной женщины, у которой произошел выкидыш, но позднее она поправилась.
Специалисты из клиники Kenema проследили за действиями этой беременной женщины вплоть до похорон одного целителя, который при жизни переходил расположенную неподалеку границу и лечил на территории Гвинеи пациентов, заразившихся вирусом Эбола. Поскольку местный обычай погребения часто связан с очищением тела, местные похороны могут служить источником передачи вируса. Поэтому еще 13 женщин, присутствовавших на тех же похоронах, были также инфицированы.
В течение следующего месяца команда специалистов собрала пробы крови у пациентов с вирусом Эбола в клинике Kenema. Кроме того, члены исследовательской группы провели беседы с пациентами, а также с местными жителями. К сожалению, подобного рода полевая работа связана с очень серьезным риском заражения — пять из соавторов этого исследования заразились вирусом Эбола и умерли еще до публикации его результатов. Среди них был и известный врач Шейк Умарр Хан (Sheik Humarr Kahn).
В результате удалось получить 99 вирусных геномов от 78 пациентов, а также идентифицировать 395 уникальных мутаций. В Сьерра-Леоне сотрудники лаборатории смогли сопоставить различия в геномах у разных пациентов с данными, полученными специальными санитарными группами в клинике Kenema. «Небольшие мутации покажут отношения между отдельными случаями», — отмечает Сабети. Сравнивая полученные геномы с теми, которые были взяты у пациентов в Гвинее, а также с 20 геномами предыдущих вспышек, исследователи установили передаточный цикл вируса и его эволюционную историю.
«Одно из наших самых больших опасений состоит в том, что вирус Эбола может стать более трансмиссивным, чем в настоящее время, — отмечает Бик. — Важно использовать генетические данные при решении этой проблемы».